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En el año 82 ganó por oposición la Cátedra de Oftalmología de la Facultad de Medicina de la Universidad de La Laguna, y unos meses más tarde por concurso de traslado, alcanzó la Cátedra de Oftalmología de la Universidad de Oviedo.
En el año 83 fue nombrado Jefe del Servicio de Oftalmología del Hospital General de Asturias, cargo que desempeña en la actualidad.
En este sentido es de destacar que fue el Catedrático de Oftalmología más joven de España. Asi mismo, realizó numerosas estancias en el extranjero en distintos Servicios donde completó su formación y durante 3 años colaboró con el Dr.Castroviejo en toda su actividad clínica y quirúrgica y del que heredó su interés por la patología del segmento anterior del ojo. En este sentido hoy día se puede considerar un experto en cirugía de la córnea y del cristalino, (queratoplastias, lensectomía y técnicas de cirugía refractiva).
Es autor de más de 150 publicaciones en las revistas más prestigiosas de la Especialidad, asi como de numerosas ponencias y conferencias en Congresos Nacionales e Internacionales y en la mayoría de las Universidades españolas.
Entre sus libros editados figuran: “Patología inflamatoria del segmento anterior del ojo y Anejos oculares”, Ediciones Luzan 5, S.A (1.993), “Facoemulsificación y Emetropia” (Secoir-2001) y ha colaborado con la autoría de varios capitulos en otras publicaciones de distintos profesionales de la oftalmología.
Entre sus artículos caben destacar entre otros: “Lente intraocular difractiva multifocal. Resultados clinicos”, (Arch.Soc.Esp.Oftal, 61, 135-138, 1991) ó “Clear lens extraction for the correction of high miopía”, Ophthalmology, Vol.110, num.12, Diciembre, 2003.
Posee numerosos premios, destacando entre ellos el Premio Hermenegildo Arruga y el Premio Ramón Castroviejo.
Es miembro de las Sociedades Oftalmológicas más importantes del mundo, habiendo sido Presidente de la Sociedad Española de Cirugía Ocular Implanto-Refractiva, (SECOIR), de la que ahora es Presidente de Honor.
Ha formado parte en diversas ediciones del jurado que concede el galardón correspondiente a Investigación Científica y Técnica de los Premios Principe de Asturias.
En el mes de octubre del 2005 fue nombrado Académico de Número por la Academia Médico-Quirúrgica Española.
Dentro de la contribución científica del Prof. Fernández-Vega, se podrían destacar dos líneas de investigación; la primera sería que se puede considerar como el introductor en España de la Cirugía del Cristalino Transparente para la corrección de las ametropías, una de las técnicas más importantes dentro de la cirugía refractiva. Sus trabajos sentaron las bases de las indicaciones, contraindicaciones y complicaciones de la mencionada técnica.
Pionero en el empleo de las lentes intraoculares multifocales, habiendo participado en todos los Estudios Multicéntricos que se desarrollaron con ellas.
En la actualidad trabaja con el resto de los componentes de su familia de la que es parte de la 4ª generación en el INSTITUTO OFTALMOLÓGICO FDEZ-VEGA, en el que actúa como Director Médico.
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